阵容搭配的核心要点在于平衡输出、控制、治疗和防御能力。不同主角（如火主、风主、雷主等）的阵容构建逻辑存在显著差异，需根据角色特性选择适配忍者。例如火主擅长火遁和幻术，适合搭配佐助、手鞠等高爆发忍者，通过奥义定身和普攻火旋风形成控制链；而风主依赖刷新机制，可搭配手鞠、我爱罗等实现多轮技能循环。阵容需考虑追打连击的触发条件，确保技能衔接流畅性，避免因查克拉不足或冷却时间导致输出断层。
平民玩家需优先选择易获取且升星成本低的SS级或S级忍者过渡，如大蛇丸、宇智波佐助、我爱罗等。这类忍者通过首充礼包、限时招募或日常活动即可获得，且强度足以应对前期副本和竞技场。过渡阵容建议采用2-3个SSS核心搭配2-3个SS级辅助，例如大蛇丸+佐助+鸣人+雏田+井野的组合，既能保证输出又可兼顾生存。需注意避免盲目追求全SSS阵容，合理分配资源培养关键角色才是提升战力的高效途径。
属性克制与站位安排是实战中的关键细节。土主和水主分别依赖护盾和毒伤机制，前者需将防御型忍者（如君麻吕）置于前排吸收伤害，后者则需通过淬毒被动叠加持续伤害。速攻型阵容建议采用横排站位，1号位放置高先攻控制忍者（如宁次），利用打断技能抢占先机；而消耗型阵容需将治疗忍者（如纲手）置于后排保护。需根据敌方阵容调整属性克制，例如风属性忍者对雷属性有天然优势。
后期阵容需注重忍者羁绊和技能联动效果。晓组织成员（如长门、鬼鲛）的群体减怒和禁止攻击技能可形成强力控场，搭配雷主的根性被动能显著提升生存能力。五影组合则依赖高额护盾和结界效果，适合持久战。需特别注意被动技能的叠加收益，例如雷影的无双被动与雷主鬼人技能的配合可大幅提升普攻伤害。通灵兽的选择也需与阵容定位匹配，白蛇适合控制流，忍猫则适配高连击队伍。
优化阵容时需要持续关注版本更新和忍者调整。新忍者的加入可能改变原有克制关系，例如近期上线的漂泊带土对传统速攻阵容有较强压制力。建议定期参与限时活动获取新忍者碎片，并通过忍者考试和据点探索测试阵容强度。对于网络卡顿等影响操作的问题，可适当降低画质或调整技能释放时机以确保连招稳定性。最终目标是构建一套适应多场景的泛用阵容，而非追求绝对强度。
